Mutsuko Kuribayashi et al. 2023Clinical influence of multiplex PCR routine uses in urgent pediatric admissions

Abstruct

Background

The coronavirus disease 2019 outbreak has prompted some hospitals to implement screening tests upon admission since 2019. FilmArrayR Respiratory 2.1 Panel (FilmArray) is a multiplex polymerase chain reaction (PCR) test with high sensitivity and specificity for detecting respiratory pathogens. We aimed to assess the clinical influence of FilmArray routine use for pediatric patients, including those without symptoms suggestive of an infection.

コロナウイルス感染症2019年の流行により、2019年から入院時にスクリーニング検査を実施する病院があります。
FilmArrayR Respiratory 2.1 Panel(FilmArray)は、呼吸器病原体を検出するための高い感度と特異性を有する多重ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)検査である。
我々は、感染症を示唆する症状のない患者を含む小児患者に対して、FilmArrayをルーチン使用することによる臨床的影響を評価することを目的としました。

Methods

We conducted a single-center retrospective observational study, which investigated patients aged ≤15 years who underwent FilmArray on admission in 2021. We collected the patients' epidemiological information, symptoms, and FilmArray results from their electronic health records.

我々は、2021年の入院時にFilmArrayを受けた15歳以下の患者を調査する、単一施設の後方視的観察研究を実施した。
電子カルテから患者の疫学情報、症状、FilmArrayの結果を収集した。

Results

A positive result was observed in 58.6% of patients admitted to the general ward or intensive care unit (ICU) but only in 1.5% of patients in the neonatal ward. Among the patients admitted to the general ward or ICU who tested positive, 93.3% had symptoms suggestive of infections, 44.6% had a sick contact before admission, and 70.5% had siblings. However, 62 (28.2%) out of 220 patients without the four (fever, respiratory, gastrointestinal, and dermal) symptoms also had positive results. Among them, 18 patients with adenovirus and three with respiratory syncytial virus were isolated to private rooms. However, 12 (57.1%) patients were discharged without symptoms suggestive of viral infection.

一般病棟や集中治療室(ICU)に入院した患者の58.6%に陽性反応が認められたが,新生児病棟の患者では1.5%にとどまった。
一般病棟またはICUで陽性となった患者のうち,93.3%に感染症を示唆する症状があり,44.6%に入院前に病気の接触者がいて,70.5%に兄弟姉妹がいた。
しかし、4つの症状(発熱、呼吸器、消化器、皮膚)を持たない患者220人中62人(28.2%)も陽性であった。
そのうち、アデノウイルスが18名、呼吸器シンシチアルウイルスが3名、個室に隔離されていた。
しかし、12名(57.1%)の患者は、ウイルス感染を示唆する症状がなく退院となった。

Conclusions

Multiplex PCR routine use for all inpatients may lead to excessive management of positive cases because FilmArray cannot quantify microorganisms. Thus, targets for testing should be considered carefully based on patients' symptoms and histories of sick contacts.

FilmArrayは微生物を定量化できないため、Multiplex PCRを全入院患者にルーチン使用すると、陽性症例の管理が過剰になる可能性がある。
したがって、検査対象は、患者の症状や病人との接触歴に基づいて慎重に検討する必要がある。

Introduction

The coronavirus disease 2019 (COVID-19) outbreak in December 2019 prompted some hospitals to implement screening tests such as polymerase chain reaction (PCR) and rapid antigen tests on admission for infection control. FilmArray Respiratory 2.1 Panel (FilmArray, Biomerieux) is a multiplex PCR test that can identify 21 microorganisms in nasopharyngeal swab fluid with 98% sensitivity and 100% specificity. The turnaround time required for sample preparation, amplification, detection, and analysis is approximately 45 min, allowing the rapid and accurate identification of various microorganisms. FilmArray has also been reported to be useful in detecting severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). In the pediatric setting, FilmArray was performed on patients with respiratory tract infections admitted to general wards and intensive care units (ICU) and led to epidemiological analysis, appropriate antimicrobial use, and shorter hospital stays.

2019年12月に発生したコロナウイルス感染症2019(COVID-19)を契機に、一部の病院では感染対策のため、入院時にポリメラーゼ連鎖反応(PCR)や迅速抗原検査などのスクリーニング検査を実施している。
FilmArray Respiratory 2.1 Panel(FilmArray、Biomerieux社)は、鼻咽頭ぬぐい液中の21種類の微生物を感度98%、特異度100%で同定できるマルチプレックスPCR検査である。
サンプルの前処理、増幅、検出、分析に必要な所要時間は約45分で、様々な微生物を迅速かつ正確に同定することができる。
FilmArrayは、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2(SARS-CoV-2)の検出にも有用であることが報告されています。
小児科領域では、一般病棟や集中治療室(ICU)に入院した呼吸器感染症患者を対象にFilmArrayが実施され、疫学的解析、適切な抗菌薬使用、入院期間の短縮につながった。

However, no reports on the positive rates or distribution of microorganisms using FilmArray for pediatric patients, including those admitted to the neonatal intensive care unit (NICU) and those without symptoms of infection, have been published in Japan. We therefore evaluated the clinical influence of FilmArray routine use for pediatric emergency admissions at a single institution.

しかし、新生児集中治療室(NICU)入院患者や感染症状のない患者を含む小児患者を対象としたFilmArrayによる微生物の陽性率や分布に関する報告は、国内では発表されていない。
そこで、小児救急入院患者に対するFilmArrayルーチン使用の臨床的影響について、1施設において評価した。

Method

Design

We conducted a single-center retrospective observational study at the Japanese Red Cross Society Himeji Hospital (JRCSHH). The study period was between January 1 and December 31, 2021. This was the pre-omicron period, and the number of new positive COVID-19 cases under 10 years old per month was approximately 2% of those in the omicron period.

日本赤十字社姫路病院(JRCSHH)において、単施設の後方視的観察研究を行った。
研究期間は2021年1月1日から12月31日までであった。
この期間はプレオミクロン期間であり、1ヵ月あたりの10歳未満のCOVID-19新規陽性患者数はオミクロン期間の約2%であった。

Patients and settings

Himeji City will have approximately 530,000 people (including 72,800 children under 15?years of age) by October 2022. The JRCSHH is a secondary emergency hospital with 555 beds, including 50 in the pediatric ward, 10 in the ICU, 18 in the NICU, and 24 in the growing care unit (GCU), with approximately 2500 neonatal and pediatric admissions annually. During the COVID-19 pandemic in 2021, FilmArray tests were performed on most unscheduled admissions in the pediatric department, even in asymptomatic patients. When SARS-CoV-2 was detected, patients were isolated, and the medical staff was required to wear appropriate personal protective equipment. Patients with specific microorganisms transmitted via droplets or contact infection, such as adenovirus (ADV), influenza virus, respiratory syncytial virus (RSV), Mycoplasma pneumoniae, and Bordetella pertussis, were also isolated in single-patient rooms (12 rooms in the pediatric ward and two in the ICU), even in cases without typical symptoms. When other viruses were detected, we tried to isolate even asymptomatic patients from those with negative tests or different microorganisms. We also assigned asymptomatic and symptomatic patients with the same microorganism to different rooms whenever possible.

姫路市の人口は、2022年10月までに約53万人(うち15?歳未満の小児は7万2800人)となる。
日赤医療センターは、小児科病棟50床、ICU10床、NICU18床、成長期治療室(GCU)24床を含む555床を有する二次救急病院であり、年間約2500人の新生児・小児科患者が入院している。
2021年のCOVID-19パンデミックの際には、小児科の予定外の入院患者のほとんどに、無症状の患者であってもFilmArray検査が実施された。
SARS-CoV-2が検出された場合、患者は隔離され、医療スタッフには適切な個人防護具の着用が義務付けられた。
また、アデノウイルス(ADV)、インフルエンザウイルス、呼吸器合胞体ウイルス(RSV)、肺炎マイコプラズマ、百日咳菌など、飛沫感染や接触感染する特定の微生物が検出された患者は、典型的な症状のない症例であっても、個室(小児科病棟12室、ICU2室)に隔離した。
他のウイルスが検出された場合は、無症状の患者でも検査が陰性であったり、別の微生物が検出された患者から分離するようにした。
また、同じ微生物が検出された無症状患者と有症状患者を可能な限り別の部屋に割り付けた。

Our study included patients aged ≤15 years admitted to JRCSHH who underwent FilmArray using nasopharyngeal swab fluid on admission (including patients admitted multiple times) during the study period. We excluded scheduled hospitalizations, such as patients undergoing elective surgery, because they were only tested for SARS-CoV-2 using the loop-mediated isothermal amplification method. FilmArray was also not performed on most patients diagnosed with COVID-19 using PCR testing at other institutions or those born in our hospital.

対象は、研究期間中に日赤医療センターに入院し、鼻咽頭ぬぐい液を用いてFilmArray検査を受けた15歳以下の患者(複数回入院した患者を含む)である。
ただし、SARS-CoV-2の検査はloop-mediated isothermal amplification法のみであったため、待機手術患者などの予定入院患者は除外した。
また、他施設でPCR検査によりCOVID-19と診断された患者や、当院で出生した患者のほとんどについては、FilmArrayを実施していない。

Data collection

We retrospectively obtained the following information from the electronic health records: age, sex, admission ward, diagnosis, presence of siblings, presence of sick contact before hospitalization, presence of four primary symptoms suggestive of infection (fever, respiratory, gastrointestinal, and dermal symptoms), and FilmArray results. Five pediatricians evaluated these symptoms based on descriptions in the electronic health records.

電子カルテから以下の情報をレトロスペクティブに入手した:年齢、性別、入院病棟、診断名、兄弟の有無、入院前の病人との接触の有無、感染を示唆する4つの主要症状(発熱、呼吸器症状、消化器症状、皮膚症状)の有無、FilmArrayの結果。
5人の小児科医が電子カルテの記述に基づいてこれらの症状を評価した。

Statistical analysis and ethical consideration

We compared FilmArray positive and negative cases using the Mann-Whitney U-test and χ2 tests for continuous and categorical variables, respectively. We estimated crude odds ratios (OR) and 95% confidence interval (CI). We performed binomial logistic regression analysis for variables with significant differences in these tests and calculated adjusted OR and 95% CI. All statistical analyses were conducted using EZR ver.1.61 (Saitama Medical Center, Jichi Medical University, Saitama, Japan), which is a graphical user interface for R ver.4.1.0 (The R Foundation for Statistical Computing). Two-tailed p-values <0.05 were considered statistically significant. This study was approved by the institutional ethics committees of JRCSHH (approval number 2021-44).

連続変数はMann-Whitney U検定、カテゴリー変数はχ2検定を用いてFilmArray陽性例と陰性例を比較した。
粗オッズ比(OR)と95%信頼区間(CI)を推定した。
これらの検定で有意差が認められた変数について二項ロジスティック回帰分析を行い、調整ORと95%CIを算出した。
統計解析はすべてR ver.4.1.0(The R Foundation for Statistical Computing)のGUIであるEZR ver.1.61(自治医科大学附属さいたま医療センター)を用いて行った。
両側p値<0.05を統計的に有意とみなした。
本研究は、日本赤十字社研究所の施設倫理委員会の承認を得た(承認番号2021-44)。

Results

There were 3083 admissions (including scheduled admissions) to our facility for patients aged 15 and under during this period (700 neonatal ward admissions and 2383 pediatric ward or ICU admissions), of which 1769 patients underwent testing with FilmArray (Figure 1).

この期間に当施設に入院(予定入院を含む)した15歳以下の患者は3083人(新生児病棟入院700人、小児病棟またはICU入院2383人)で、そのうち1769人がFilmArrayによる検査を受けた(図1)。

Table 1 summarizes patient characteristics. The median (range) age of patients admitted to the NICU/GCU was 0 days (0-150 days); 57.4% were males, and most were diagnosed with transient tachypnea and respiratory distress syndrome. The median (interquartile range, IQR) age of the patients admitted to the general ward or ICU was 2 years (0-5 years), and 54.9% were males. Respiratory tract infections accounted for most diagnoses during admission. Patients were also admitted for non-infectious conditions, such as Kawasaki disease, surgical diseases, and trauma. Of 1574 general ward or ICU admissions, 922 patients (58.6%) were positive for FilmArray. Only three (1.5%) of 195 patients admitted to the NICU/GCU tested positive for FilmArray, which detected SARS-CoV-2 (day 0), RSV (day 7), and human parainfluenza virus (HPIV) 3 (day 0). We confirmed that further tests using loop-mediated isothermal amplification for the patient with SARS-CoV-2 were negative twice. An additional rapid antigen test for the patient with RSV, to estimate the risk of horizontal transmission to other patients, was negative. No patients presented with symptoms suggestive of viral infection within 48 h of a positive test; we therefore lifted the cohort isolation and thoroughly continued standard precautions.

表1に患者の特徴をまとめた。NICU/GCUに入院した患者の年齢の中央値(範囲)は0日(0?150日)であり、57.4%が男性で、ほとんどが一過性頻呼吸と呼吸窮迫症候群と診断された。
一般病棟またはICUに入院した患者の年齢の中央値(四分位範囲、IQR)は2歳(0~5歳)で、54.9%が男性であった。
入院中の診断の大半は呼吸器感染症であった。
川崎病、外科疾患、外傷などの非感染性疾患による入院もあった。
1574人の一般病棟またはICU入院患者のうち、922人(58.6%)がFilmArray陽性であった。
NICU/GCUに入院した195例のうち、FilmArrayが陽性であったのは3例(1.5%)のみで、SARS-CoV-2(0日目)、RSV(7日目)、ヒトパラインフルエンザウイルス(HPIV)3(0日目)が検出された。
SARS-CoV-2患者に対するループ媒介等温増幅法を用いたさらなる検査では、2回陰性であることが確認された。
他の患者への水平伝播のリスクを推定するためのRSV患者の迅速抗原検査は陰性であった。
検査陽性後48時間以内にウイルス感染を示唆する症状を呈した患者はいなかったため、コホート隔離を解除し、標準予防策を徹底した。

Table 2 compares the positive and negative FilmArray results for 1574 patients admitted to the general ward or ICU. The median (IQR) age of the positive cases was 1 year (0-4 years), and younger than that of the negative cases, 4 years (0-9 years) (p<0.001). Among the 922 positive cases, 93.3% had symptoms suggestive of infection; 44.6% had sick contact before admission, and 70.5% had siblings. These three characteristics were significantly more frequent in positive cases than in negative cases (p<0.001 for all). All information was available for binomial logistic regression analysis for 1247 cases (test-positive: 765 cases; test-negative: 482 cases). It revealed that there were more patients with symptoms (adjusted OR 2.14, 95% CI [1.40-3.27], p<0.001) and sick contacts (adjusted OR 4.61, 95% CI [3.39-6.28], p<0.001) in the positive than the negative cases (Table 3).

表2は、一般病棟またはICUに入院した1574例のFilmArrayの陽性と陰性の結果を比較したものである。
陽性例の年齢中央値は1歳で、陰性例より若く4歳であった。
陽性症例922例のうち、93.3%に感染を示唆する症状がみられ、44.6%に入院前の病人との接触があり、70.5%に兄弟姉妹がいた。
これら3つの特徴は、陰性症例よりも陽性症例で有意に頻度が高かった。
1,247例の2項ロジスティック回帰分析にはすべての情報が利用可能であった。
その結果、陽性症例では陰性症例よりも症状を有する患者や病的接触者が多いことが明らかになった(表3)。

Figure 2 presents the percentage of microorganisms detected in 1574 patients monthly. Rhinovirus/enterovirus (RV/EV) was detected throughout the year, and HPIV3 and RSV were detected at higher rates from April to May and June to July 2021, respectively. Influenza virus, human metapneumovirus, human coronavirus (HCoV) 229E, HCoV HKU1, and B. pertussis were not detected.

図2は、1574人の患者から毎月検出された微生物の割合を示したものである。
ライノウイルス/エンテロウイルス(RV/EV)は年間を通して検出され、HPIV3とRSVはそれぞれ2021年4月から5月と6月から7月に高い割合で検出された。
インフルエンザウイルス、ヒトメタニューモウイルス、ヒトコロナウイルス(HCoV)229E、HCoV HKU1、百日咳菌は検出されなかった。

Table 4 shows the number of microorganisms detected according to age. Microorganisms were most frequently detected in patients aged 1-3 years (77.0%), and RV/EV were the most commonly detected (34.8%) in all patients. Regarding microorganisms detected by diagnosis, RSV and HPIV3 were more frequently detected in patients with lower respiratory tract infections. In contrast, ADV was more frequently detected in patients with upper respiratory tract infections (Table 5).

表4は年齢別に検出された微生物数を示したものである。
1~3歳が77.0%と最も多く,RV/EVが34.8%と最も多かった。
診断別に検出された微生物では,RSVとHPIV3が下気道感染症患者で多く検出された。
一方、上気道感染症ではADVが多く検出された(表5)。

Table 6 presents the positive rate of FilmArray based on clinical symptoms at admission. Patients with fever (66.4%) and respiratory symptoms (84.0%) were more often positive for FilmArray. However, 48.9% of patients without fever >38°C and 28.2% without the four symptoms (fever, respiratory, gastrointestinal, and dermal) were also positive. Of the 80 organisms detected in the 62 patients who did not present with any of the four symptoms, RV/EV (49; 61.3%), ADV (18; 22.5%), HPIV 3 (7; 8.8%), RSV (3; 3.7%), HCoV OC43 (2; 2.5%), and HPIV 1 (1; 1.2%) were detected. Furthermore, 18 patients with ADV and three with RSV were isolated. However, nine out of 18 (50%) and three out of three (100%) patients were discharged without developing symptoms suggestive of viral infection. Of the nine patients with ADV infection who developed symptoms, one was diagnosed with Kawasaki disease and the other with periodic fever.

表6は、入院時の臨床症状に基づくFilmArrayの陽性率を示したものである。
発熱(66.4%)と呼吸器症状(84.0%)のある患者はFilmArray陽性率が高かった。
しかし、38℃以上の発熱がない患者の48.9%、4症状(発熱、呼吸器症状、消化器症状、皮膚症状)がない患者の28.2%も陽性であった。
4症状のいずれをも示さなかった62人の患者から検出された80菌のうち、RV/EV、ADV、HPIV 3、RSV、HCoV OC43、HPIV 1が検出された。
さらに、ADVが18例、RSVが3例分離された。
しかし、18例中9例(50%)および3例中3例(100%)は、ウイルス感染を示唆する症状を発症することなく退院した。
症状が出現したADV感染患者9人のうち、1人は川崎病、もう1人は周期性発熱と診断された。

Discussion

Our retrospective observational study revealed that FilmArray performed on 1769 patients on unscheduled admission was positive in 58.6% (922 of 1574 patients) admitted to the pediatric ward or ICU and only 1.5% (3 of 154 patients) of those admitted to the neonatal ward.

われわれのレトロスペクティブ観察研究では、予定外の入院患者1769人を対象に実施したFilmArrayは、小児病棟またはICUに入院した患者の58.6%で陽性であり、新生児病棟に入院した患者ではわずか1.5%であった。

As described in a previous report, microorganisms were most frequently detected in patients aged 1-3 years in our study. Furthermore, microorganisms were more often present in symptomatic patients, consistent with the findings of a study that observed a higher viral load in symptomatic patients than in asymptomatic patients. Most infectious diseases are transmitted by droplets or contact infections. Transmission therefore increases when there are symptomatic individuals around them, including siblings, but there was also the report that having siblings itself increased the risk of respiratory tract infection. In this study, there were significantly more patients with sick contacts in the positive group than in the negative group after adjusting the potential confounders. We found that EV/RV was detected throughout the year, while the proportion of HPIV3 and RSV varied with the season. Furthermore, non-enveloped viruses, such as EV/RV, continued to be detected after the COVID-19 pandemic, possibly due to viral properties. In Japan, many HPIV3 cases were detected in June 2021, and outbreaks in nursery schools have also been reported. In addition, there have been reports of RSV resurgence in August 2021 after the COVID-19 pandemic. Based on the above findings, the trends of both viruses in our study indicate the Japanese pandemic. As severe RSV and HPIV3 infections are more likely to cause bronchiolitis and pneumonia, we observed that they were detected more frequently in lower respiratory tract infections in hospitalized patients in this study.

以前の報告で述べたように、微生物が最も多く検出されたのは1~3歳の患者であった。
さらに、無症状の患者よりも有症状の患者の方がウイルス量が多いという研究結果とも一致していた。
ほとんどの感染症は飛沫感染や接触感染によって伝播する。
そのため、兄弟姉妹を含め、周囲に症状のある人がいると感染が増加するが、兄弟姉妹がいること自体が呼吸器感染のリスクを高めるという報告もあった。
本研究では、潜在的交絡因子を調整した結果、陽性群では陰性群に比べ、病気の接触者を持つ患者が有意に多かった。
EV/RVは年間を通して検出されたが、HPIV3とRSVの割合は季節によって異なることがわかった。
さらに、COVID-19パンデミック後もEV/RVのような非エンベロープウイルスが検出されたが、これはおそらくウイルスの特性によるものであろう。
日本では2021年6月にHPIV3が多く検出され、保育園での集団発生も報告されている。
また、COVID-19パンデミック後の2021年8月にはRSVの再流行が報告されている。
以上のことから、本研究における両ウイルスの動向は、日本でのパンデミックを示唆している。重症のRSVおよびHPIV3感染症は気管支炎や肺炎を起こしやすいことから,本研究では入院患者の下気道感染症で多く検出された.

Based on this study, the routine use of FilmArray for all inpatients may lead to over management for positive cases due to its inability to quantify microorganisms. We detected microorganisms in approximately 30% of patients with no findings suggestive of infection. In a previous study, microorganisms were detected in 26.7%-41.7% of pediatric patients without fever or respiratory tract symptoms using nucleic acid and PCR tests. The most frequently detected microorganisms were RV/EV, ADV, and HCoV (HKU1, NL63, 229E, or OC43). In contrast, RSV was less commonly detected in asymptomatic patients, consistent with our findings. Virus detection in asymptomatic patients does not depend on infectivity and viruses may be detected long after infection. For instance, RV has been detected in asymptomatic patients for up to 3 months. FilmArray's disadvantage is that it cannot quantify microorganisms, making it difficult to estimate the infectivity. For example, even if the threshold cycle of SARS-CoV-2 exceeded, FilmArray detected SARS-CoV-2 with high sensitivity without clear evidence of infectivity. As with other microorganisms, a positive FilmArray result does not indicate that the organism is infectious. In our study, positive FilmArray results without symptoms may have led to excessive infection control regardless of infectivity. Among the 21 asymptomatic patients (18 with ADV and 3 with RSV) on admission who were isolated in private rooms throughout their hospitalization, 12 (57.1%) were discharged without developing symptoms of infection. Previous reports have also described the possibility that positive PCR test results may lead to negative consequences, such as unnecessary isolation of hospitalized patients. Furthermore, in our study, only three patients admitted to the NICU/GCU had positive FilmArray results, two of which had additional negative tests. Neonates have infrequent contact with infected patients immediately after birth. Routine FilmArray may therefore be unnecessary in neonates, except in cases of high pretest probability, such as having an infected mother or in facilities with outbreaks.

本研究によれば、FilmArrayを全入院患者にルーチンで使用することは、微生物を定量できないため、陽性症例の過剰管理につながる可能性がある。
我々は、感染を示唆する所見のない患者の約30%から微生物を検出した。
以前の研究では、発熱や呼吸器症状を伴わない小児患者の26.7%~41.7%から核酸検査やPCR検査で微生物が検出された。
最も多く検出された微生物はRV/EV、ADV、HCoV(HKU1、NL63、229E、OC43)であった。
一方、RSVは無症状の患者ではあまり検出されなかった。
無症候性患者におけるウイルスの検出は感染性に依存せず、感染後長期間経過してから検出されることもある。
例えば、RVは無症状の患者から最長3ヵ月間検出されている。
FilmArrayの欠点は、微生物を定量できないことであり、感染力を推定することが困難である。
例えば、SARS-CoV-2の閾値サイクルを超えても、FilmArrayは感染性を明確に示すことなく高感度でSARS-CoV-2を検出した。
他の微生物と同様に、FilmArrayが陽性であったからといって、その微生物が感染性であるとは限らない。
本研究では、症状がないのにFilmArrayが陽性であったため、感染性にかかわらず過剰な感染制御が行われた可能性がある。
入院中に個室に隔離された入院時無症状患者21名(ADV18名、RSV3名)のうち、12名(57.1%)が感染症状を発症することなく退院した。
これまでの報告では、PCR検査の結果が陽性であった場合、入院患者を不必要に隔離するなどの否定的な結果につながる可能性も述べられている。
さらに、本研究では、NICU/GCUに入院した患者のうち、FilmArray検査結果が陽性であったのは3例のみで、そのうち2例はさらに陰性であった。
新生児は出生直後から感染者と接触する機会が少ない。
したがって、母親が感染している場合やアウトブレイクが発生している施設など、検査前の確率が高い場合を除き、新生児にルーチンのFilmArrayは不要であろう。

Our study had five limitations. First, it was a retrospective observational study conducted at a single institution. A multicenter case series is therefore needed to generalize our findings. Second, we could not evaluate the necessity for the FilmArray as a screening test because we did not assess cost-effectiveness and whether the microorganisms were transmitted to other patients from test-positive asymptomatic patients in a non-single room. Third, most patients diagnosed with COVID-19 before admission were excluded from the study. Microorganisms co-infected with SARS-CoV-2 have not been adequately evaluated because FilmArray was not performed in 15 COVID-19 cases. Fourth, we could not confirm the symptoms after discharge in patients isolated from private rooms. Finally, because infection control policies vary based on facility, our department's policy of isolating asymptomatic patients with ADV or RSV may have been excessive compared to other institutions. The Centers for Disease Control and Prevention guidelines in the US recommend private room isolation for those infected by droplet- or contact-transmitted microorganisms. Nevertheless, all Japanese hospitals may face infection control challenges owing to the limited number of private rooms and medical staff. In the event that FilmArray detects unexpected microorganisms, infection control rules must be carefully considered.

われわれの研究には5つの限界があった。
第1に、1施設で行われたレトロスペクティブな観察研究である。
したがって、我々の知見を一般化するには、多施設でのケースシリーズが必要である。
第2に、スクリーニング検査としてのFilmArrayの必要性を評価することができなかった。費用対効果や、検査陽性の無症候性患者から他の患者に微生物が感染するかどうかを非単一病室で評価しなかったからである。
第3に、入院前にCOVID-19と診断された患者のほとんどが研究から除外された。
15例のCOVID-19症例ではFilmArrayが実施されなかったため、SARS-CoV-2と共感染した微生物は十分に評価されていない。
第4に、個室から隔離された患者の退院後の症状を確認できなかった。
最後に、感染管理方針は施設によって異なるため、ADVまたはRSVに罹患した無症状の患者を隔離するという当科の方針は、他の施設と比較して過剰であった可能性がある。
米国疾病予防管理センターのガイドラインでは、飛沫感染または接触感染した微生物に感染した患者を個室に隔離することを推奨している。
とはいえ、日本の病院では個室の数や医療スタッフの数が限られているため、どの病院でも感染対策上の問題に直面する可能性がある。
FilmArrayで予期せぬ微生物が検出された場合、感染管理ルールを慎重に検討する必要がある。

Conclusion

We evaluated the clinical influence of routine FilmArray for pediatric emergency admissions. FilmArray helps identify various microorganisms with high sensitivity and specificity. However, because FilmArray cannot quantify microorganisms, its routine use for all inpatients may lead to excessive management of positive cases. Its adaptation should therefore be considered.

我々は、小児救急入院患者に対するルーチンのFilmArrayの臨床的影響を評価した。
FilmArrayは高い感度と特異性で様々な微生物の同定に役立つ。
しかし、FilmArrayは微生物を定量できないため、すべての入院患者にルーチンで使用することは、陽性症例の過剰管理につながる可能性がある。
したがって、その適応を検討すべきである。

アップロード日:2023年5月3日
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